甘蓝型油菜RRS-like1和RRS-like2基因表达特征及进化分析  

张姗姗1 , 高亚婷1 , 李晋1 , 郭亚娇1 , 杜春芳2 , 王景雪1*
1 山西大学生命科学学院, 太原, 030006; 2 山西省农业科学院棉花研究所, 运城, 044000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2019年10月07日    接受日期: 2019年10月18日    发表日期: 2021年03月14日
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摘要

甘蓝型油菜(Brassica napus L.)作为中国乃至世界上重要的油料作物,在生产上常受到病虫危害而导致产量降低。NBS-LRR 类基因已经被证明是一类广谱抗病基因,在拟南芥、水稻等作物中 NBS-LRR 类抗病蛋白参与对多种病原微生物的防御响应。本课题组通过对高/低油近等基因系材料做转录组分析筛选得到两个 NBS-LRR 类差异表达基因分别命名为 BnRRS1-like BnRRS2-like,对 BnRRS1-like BnRRS2-like基因进行了系统发育进化分析,结果表明,BnRRS1-likeBnRRS2-like 基因与拟南芥 RRS1-R 基因高度同源。NCBI 同源序列比对发现 BnRRS1-like 基因和 BnRRS2-like 基因与拟南芥 RRS1-R 基因相似度分别为60.68%52.39%。对 BnRRS1-like BnRRS2-like 基因编码的蛋白质序列分析结果表明:BnRRS1-like
(BnaC09g18980)
BnRRS2-like 蛋白(BnaA01g01460)均含有“TIR”“NBS”“LRR”保守结构域,属于 TIR-NBSLRR 类抗病蛋白。保守基序分析得出 BnRRS1-like BnRRS2-like 基因有非常相似的保守基序。通过染色体定位结果表明,BnRRS1-like BnRRS2-like 基因分别定位于染色体 C9 A1 位置上。利用 qRT-PCR 技术分析发现,BnRRS1-like BnRRS2-like 均在油菜叶片中含量最高,其次是根,花中表达量最低。在油菜成株后进行核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)菌核接种后,测定不同诱导时间 BnRRS1-like BnRRS2-like 基因相对表达量,发现接种菌核病菌 3 h BnRRS1-like BnRRS2-like 基因表达量明显上升,12 h 达到最大值。结果证明,BnRRS1-like BnRRS2-like 为油菜抗菌核病相关基因。
 

关键词
甘蓝型油菜(Brassica napus L.);; BnRRS1-like; BnRRS2-like; 组织特异性表达; 生物信息学

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